2020年02月26日11:01 來源:科技日報
本報記者 張 曄
新冠肺炎疫情發(fā)生以來,關(guān)于核酸檢測假陰性率過高的話題,一直是各方關(guān)注的焦點。有報道稱,以熒光定量RT-PCR作為檢測手段的新冠病毒檢測的陽性率目前僅有30%—50%,導(dǎo)致奇高的假陰性率。
導(dǎo)致假陰性率發(fā)生的原因很多。2月22日,南京大學模式動物研究所發(fā)育生物學與遺傳學教授趙慶順接受科技日報記者獨家采訪時指出,依據(jù)有關(guān)機構(gòu)發(fā)布的指南,核酸檢測前需將采集到的樣品進行56℃滅活,這極有可能使新冠病毒核酸被降解,從而導(dǎo)致不能被正常檢出,最終提高了假陰性率。該研究成果《病毒核酸提取前的高溫滅活過程顯著降低可檢出病毒核酸模板量》,已在中國科學院科技論文平臺預(yù)發(fā)布。
56℃滅活可能導(dǎo)致病毒核酸被降解
2019新型冠狀病毒的遺傳物質(zhì)是單鏈RNA。因此,科研人員的目標是在患者身上找到新冠病毒的RNA。這也是臨床診斷金標準。
目前,臨床檢測主要采用熒光定量RT-PCR試劑盒檢測。該方法是將標本中的特定RNA序列逆轉(zhuǎn)錄后進行擴增,經(jīng)過30次以上擴增后,病毒基因片段達到一定數(shù)量即可進行可視檢測。
“理論上,哪怕模板只有1個病毒,就有可能被檢測出來?!壁w慶順說,科研實踐中,在模板(病毒)量大于100個的情況下,擴增結(jié)果就會非常穩(wěn)定。
但是,趙慶順在網(wǎng)絡(luò)上看到一個教學視頻,不禁心生疑慮。該視頻由北京協(xié)和醫(yī)院和北京市衛(wèi)健委聯(lián)合制作。視頻3分08秒至3分40秒顯示:在制備核酸模板前,需將采集到的樣品在56℃條件下進行30分鐘病毒滅活。
記者在中華醫(yī)學會檢驗醫(yī)學分會發(fā)布的《2019新型冠狀病毒肺炎臨床實驗室檢測的生物安全防護指南(試行第一版)》中也看到:核酸擴增前,可以對標本先行消毒。包括56℃孵育30分鐘,加蛋白酶K。
中華醫(yī)學會檢驗醫(yī)學分會發(fā)布的《新型冠狀病毒肺炎病毒核酸檢測專家共識》中,明確指出需將樣品56℃孵育至少45分鐘或更高溫度進行滅活。
記者通過采訪確認,絕大多數(shù)檢驗醫(yī)師均按照上述規(guī)范,進行56℃條件下時間不等的病毒滅活,然后才制備核酸模板。
這樣做帶來的問題是,病毒RNA極易被核糖核酸酶降解,因為這種酶在60℃時活性最高。核糖核酸酶來自兩方面,一是樣本細胞內(nèi),二是采集、保存、運輸過程中的外來污染物。
進行滅活處理是出于生物安全的考慮
“進行滅活處理是出于生物安全的考慮,保護從事檢測的工作人員不被病毒感染?!壁w慶順說。
正是出于這方面的考慮,國家衛(wèi)健委發(fā)布的相關(guān)文件中,明確要求對標本進行滅活處理。
北京協(xié)和醫(yī)院制作的教學視頻以及中華醫(yī)學會檢驗醫(yī)學分會發(fā)布的《防護指南》和《專家共識》,依據(jù)正是來自國家衛(wèi)健委相關(guān)文件,包括《新型冠狀病毒實驗室生物安全指南(第二版)》《新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術(shù)指南(第三版)》等。
但是,記者查詢了國家衛(wèi)健委相關(guān)文件,其對于病毒滅活的具體方法并未做出明確規(guī)定,只是籠統(tǒng)地要求:感染性材料或活病毒在采用可靠的方法滅活后進行的核酸檢測。
趙慶順進一步查閱了美國疾控中心、香港大學公共衛(wèi)生學院以及華大基因發(fā)布的核酸檢測說明,也未發(fā)現(xiàn)56℃滅活這一步驟。
病毒核酸降解對檢測結(jié)果影響究竟有多大
記者在采訪中發(fā)現(xiàn),不同人士對這個問題的回答涇渭分明:
來自疾控部門、中國醫(yī)學會檢驗醫(yī)學分會、相關(guān)醫(yī)院檢驗醫(yī)師的看法是,不會對檢測結(jié)果有太大的影響。而趙慶順等專家認為,核酸提取前對人體樣品進行高溫殺毒處理,可能是導(dǎo)致新冠病毒核酸檢出假陰性率過高的重要原因之一。
趙慶順以豬流行性腹瀉病毒(一種冠狀病毒,來自活疫苗)為模型開展了高溫滅活對病毒可檢出量影響的研究,結(jié)果表明:保存在普通等滲溶液(Hank’s液)中的樣品經(jīng)56℃孵育30分鐘,導(dǎo)致樣品中可檢出的冠狀病毒模板減少一半,如果以92℃孵育5分鐘,則可檢出的冠狀病毒模板損失96%以上。
“理論上,不排除新冠病毒的目標RNA片段在56℃以上高溫滅活中不易被降解的可能?!壁w慶順坦言,“但我寧愿自己的判斷是錯的,也不希望因為某個細節(jié)考慮不周而導(dǎo)致檢測結(jié)果出現(xiàn)假陰性?!?/p>
另外,不同品牌的樣品保存液,也會對檢測結(jié)果產(chǎn)生較大影響。趙慶順在實驗中發(fā)現(xiàn),在56℃30分鐘條件下,采用南京諾唯贊研發(fā)的R503保存液存放豬流行性腹瀉病毒樣品時,病毒核酸的可檢出量是對照組(Hank’s液)檢出量的3倍;而如果是92℃5分鐘滅活,則檢出量是對照組的42倍。
中華醫(yī)學會檢驗醫(yī)學分會主任委員王成彬教授在撰文回應(yīng)核酸檢測假陰性率較高現(xiàn)象時也指出,不同提取試劑對最后提取到的核酸數(shù)量和質(zhì)量可能存在差別,從而直接影響檢測結(jié)果。他建議,對于某些高度疑似病例,或檢測結(jié)果難以確定的病例,建議用2種以上試劑進行檢測、驗證。
“假陰性意味著漏檢,不僅會導(dǎo)致臨床中對疑似患者不能快速確診,而且會使漏檢者成為潛在的病毒傳染源?!壁w慶順為此提出建議,一是盡量使用無核糖核酸酶污染的樣本采集管,二是將標本放置在可保護病毒核酸免受高溫滅活損壞的樣品保存液中,從而確保樣品RNA從保存、運輸?shù)礁邷販缁畹鹊玫饺瘫Wo,盡最大可能保證用于臨床檢測的核酸質(zhì)量,減少病毒核酸可檢出模板在核酸提取前的人為損壞。
4月27日,該患者從俄羅斯經(jīng)西安入境,核酸檢測陽性,診斷為新冠肺炎確診病例,在西安市就地住院治療 該女性為2月8日確診的新冠肺炎患者治愈數(shù)月后“復(fù)陽”,非新發(fā)病例,目前該患者再次隔離治療
記者了解到,初次核酸檢測為陰性、隨后確診的病例,并非第一次發(fā)生,此前,一些新冠肺炎患者甚至多次核酸檢測均為陰性。隨著6月中旬新一輪本土病例的出現(xiàn),北京逐步擴大核酸檢測的范圍,僅東城區(qū),從6月14日到6月25日,就有62萬人接受集中核酸檢測。
P3實驗室是廣東省第二人民醫(yī)院“手撕病毒”的秘密武器之一,每天,有400多份新冠肺炎核酸檢測均在這里開展。廣東省第二人民醫(yī)院新冠病毒核酸檢測就是在P3實驗室開展的。該院檢驗醫(yī)學部副主任技師胡亮杉是進入P3負壓實驗室完成設(shè)備調(diào)試、程序設(shè)定、試劑試用等前期準備工作的第一人。
3月4日,武漢市的累計治愈患者數(shù)首次超過了現(xiàn)有確診數(shù),越來越多的患者康復(fù)出院。由于康復(fù)患者中仍然存在“假陰性”的可能,轉(zhuǎn)運工作人員存在一定的暴露風險,但依舊有大量志愿者自愿報名加入了出院患者轉(zhuǎn)運專班。
近日,中日醫(yī)院出現(xiàn)一名三次咽拭子檢測均為陰性、通過下呼吸道樣本才確診“新冠肺炎”的患者。“狡猾”、“詭異”,這是中山大學附屬三院感染科副主任林炳亮對新冠病毒的第一印象。
目前看來,新冠病毒感染的病人,典型的有發(fā)熱、咳嗽、有肺炎,但也有很多病人不發(fā)熱、不咳嗽,甚至沒有明顯的肺炎?!睂O永昌個人認為,SARS病毒引起的感染也會是多種表現(xiàn)形式的,只是受當時科技條件所限,沒有能夠發(fā)現(xiàn)而已。
夏女士家住武漢市青山區(qū),家中七口人,公婆、父母、丈夫、她和三歲大的孩子。2月10日,夏女士稱有個好消息,她母親身體已康復(fù),11日可出院。她三歲孩子做的核酸檢測,兩次陽性一次陰性,目前仍在兒童醫(yī)院隔離觀察。
2月9日,湖北省新冠肺炎疫情防控指揮部召開新聞發(fā)布會。華中科技大學公共衛(wèi)生學院副院長徐順清表示,核酸檢測存在一定的假陰性,也就是一部分病人沒有檢測出來。
國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機制今天召開新聞發(fā)布會,介紹疫情防控中重要生活物資生產(chǎn)保供等有關(guān)情況。新冠病毒現(xiàn)在還沒有證實可以通過糞口消化道傳播,將食物洗凈煮熟、飯前便后洗手,可以預(yù)防病毒經(jīng)過消化道傳播。
近日,關(guān)于核酸檢測容易出現(xiàn)“假陰性”的結(jié)果基本已在醫(yī)療界形成共識,不僅中日友好醫(yī)院出現(xiàn)一名三次咽拭子測試均為陰性、通過下呼吸道樣本才確診“新冠肺炎”的患者,連中國工程院副院長王辰也指出,核酸對于真實病例的檢測率不過30%至50%。
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